Задача изучения белков потребовала дополнительных кластерных ресурсов

32 процессора AMD Athlon MP добавились к 24 процессорам для высокопроизводительных расчетов в физико-химической биологии и биоинженерии.

Вычислительный кластер из 24-х процессоров AMD Athlon MP для изучения белковых структур в Институте биоорганической химии им. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН (ИБХ РАН), поставленный в первой половине 2003 года компанией “ДАТА Технологии”, потребовал расширения своих мощностей. Эта миссия была доверена “ДАТА Технологии”.

Поставка и установка аппаратной части нового 32-х процессорного кластера была завершена в конце декабря, а наладка всей системы, настройка параллельных библиотек прошла в начале января 2004 года.

Новый кластер состоит из 16 двухпроцессорных узлов (nodes). Каждый узел построен на материнской плате TYAN Tiger DUAL с двухпроцессорной системой Athlon MP 2800+ корпорации AMD, диске 40 ГБ и 1 ГБ оперативной памяти. Управляющая машина базируется на процессоре AMD Athlon XP 2400+ с коммутационной средой Ethernet 10/100. На новом кластере установлена высокопроизводительная межпроцессорная коммутационная среда Myrinet за счет предыдущего кластера. Кластер же из 24-х процессоров переведен на Gigabit Ethernet. В качестве операционной системы используется Red Hat Linux. Расчетная производительность нового кластера составляет 65 Gflops.

На кластерном комплексе используется параллельное программное обеспечение для расчетов структуры и функции глобулярных и мембранных белков методами молекулярной динамики, Монте-Карло, моделирования на основании гомологии.

Таким образом, расчеты для изучения белков в ИБХ РАН осуществляются на кластере из 56-и процессоров.

Процессоры корпорации AMD Athlon MP использованы в связи с тем, что дают лучшие показатели по параметру цена/производительность.

Подробнее о научных задачах, решаемых на кластере, и 24-х процессорном кластере можно узнать на странице web-сайта http://datatec.ru/show.php?id=9.





О КОМПАНИИ



Компания “ДАТА Технологии” нацелена на задачи системной интеграции в области информационных технологий для организаций науки и образования, промышленных предприятий, финансовых структур и других компаний.

В качестве основных решений и систем компания предлагает:

- кластерные и серверные комплексы на базе процессоров AMD и Intel c архитектурой 32/64-бит;

- системы централизации вычислений на базе серверов и терминальных устройств;

- системы и технологии резервного копирования, архивирования и хранения данных, включая NAS, SAN, SAS;

- системное и прикладное ПО.

Компания осуществляет полный набор услуг, включая анализ и экспертизу существующей информационно-вычислительной системы, разработку проекта ее модернизации и развития, поставку, установку и настройку оборудования и ПО, гарантийное и сервисное техническое обслуживание системы в целом и отдельных устройств.





Контактное лицо: Чернин Игорь Юрьевич (менеджер по маркетингу)

Телефоны: 330-7401, 771-0124

Факс: 330-7401

E-mail: chernin@datatec.ru

URL: www.datatec.ru

Опубликовано: 26 января 2004 г.

Ключевые слова: нет

Извините, комментариев пока нет